Utilidad de la Espectroscopia Raman para el diagnóstico rápido y la tipificación de microorganismos de interés clínico

Datos básicos

Código:

INNVAL19/17

Dotación:

12.000,00 €

Año Inicial:

2019

Año final:

2022

Objetivos del proyecto

La espectroscopia Raman es una técnica fisicoquímica que puede ser muy útil para la identificación rápida de microorganismos, ya que permite generar una huella digital espectroscópica de la muestra microbiana, proporcionando una información cuantitativa y cualitativa que permite discriminar y caracterizar microorganismos, tanto en una mezcla de bacterias como a nivel de una sola célula. El desarrollo de esta tecnología han aumentado dramáticamente en los últimos años debido a la mejora de la señal y a la disponibilidad de instrumentación y software fáciles de usar, lo cual ha permitido el acceso no especializado a este enfoque de ciencias físicas para aplicaciones biológicas entre las que se encuentra la identificación microbiana. En nuestro hospital existe cada vez más la necesidad de implantar nuevas metodologías para una detección e identificación rápidas y precisas de microorganismos, fundamentalmente de bacterias multirresistentes, ya que de esta manera podremos asegurar con rapidez la implantación de medidas terapéuticas adecuadas y estrategias de control para prevenir la morbi-mortalidad en pacientes con riesgo, así como la diseminación y transmisión a otros pacientes. En este proyecto nos proponemos como Objetivo: desarrollar un esquema de identificación y caracterización de diferentes patógenos humanos de interés clínico, basado en la Espectroscopia Raman, cuya aplicación sea transferible al uso rutinario en el laboratorio de Microbiología Clínica. Diseño: Estudio aplicado sobre la utilidad de la espectroscopia Raman para la identificación y caracterización de microorganismos en el laboratorio de Microbiología Clínica. Ámbito de estudio: Laboratorio de Microbiología del Instituto Marqués de Valdecilla (IDIVAL). Sujetos de estudio: Se estudiaran un total de 300 cepas clínicas de diferentes especies patógenas de interés clínico que incluyen bacterias gram-negativas,gram-positivas, entre las que se encuentran patógenos de llamado grupo ESKAPE (Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa y Enterobacter spp), así como hongos (Aspergillus spp.) y levaduras (Candida spp.), las cuales han sido previamente identificadas mediante el sistema automatizado Vitek-2 y/o espectrometría de masas MALDI-TOF utilizando el sistema Vitek MS. Se incluirán cepas de referencia de las colecciones ATCC y NCTC. Instrumentación: Espectroscopia de Raman, MALDI-TOF, electroforesis en geles de agarosa, electroforesis de campo pulsado, software para análisis de espectros. Determinaciones: Espectros Raman de bacterias, hongos y levaduras a partir de cultivos puros y en infecciones experimentales mono y polimicrobianas. Análisis electroforético de ADN, Determinaciones de perfiles de PFGE, comparación de patrones de PFGE con perfiles espcetrales de Raman y MALDI-TOF. Análisis estadistico multivariable (PCA). Test de correlación de Pearson.

Unidades de investigación

• ENFERMEDADES INFECCIOSAS Y MICROBIOLOGIA CLÍNICA

  

  Investigador Responsable

  María Del Carmen Fariñas Álvarez

  mcarmen.farinas@scsalud.es